Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms