Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HmgcrQ01237 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms