Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2bQ01097 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms