Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PrcdQ00LT2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms