Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms