Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms