Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms