Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gfra1P97785 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms