Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkp1P97350 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms