Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms