Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr4P70658 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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