Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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