Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Crnkl1P63154 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Crnkl1P63154 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Crnkl1P63154 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Crnkl1P63154 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Crnkl1P63154 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Crnkl1P63154 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crnkl1P63154 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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