Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rps11P62281 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms