Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Lmo4P61969 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lmo4P61969 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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