Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Copz1P61924 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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