Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppfia3P60469 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms