Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms