Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms