Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TdgP56581 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TdgP56581 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TdgP56581 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms