Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf5P56477 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms