Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CnbpP53996 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms