Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HccsP53702 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HccsP53702 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HccsP53702 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HccsP53702 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HccsP53702 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
HccsP53702 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HccsP53702 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HccsP53702 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HccsP53702 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HccsP53702 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HccsP53702 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms