Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CcnfP51944 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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