Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms