Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnni3P48787 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms