Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VdrP48281 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
VdrP48281 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VdrP48281 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms