Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrprbP47758 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrprbP47758 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms