Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Myo1bP46735 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Myo1bP46735 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms