Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms