Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpardP35396 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpardP35396 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpardP35396 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpardP35396 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpardP35396 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpardP35396 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpardP35396 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpardP35396 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpardP35396 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpardP35396 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpardP35396 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpardP35396 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms