Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms