Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnd1P30999 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnd1P30999 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnd1P30999 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnd1P30999 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnd1P30999 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnd1P30999 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms