Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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