Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxraP28700 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxraP28700 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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