Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NapbP28663 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NapbP28663 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms