Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Celf1P28659 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms