Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Hoxd10P28359 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd10P28359 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd10P28359 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd10P28359 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd10P28359 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd10P28359 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hoxd10P28359 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd10P28359 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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