Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vav1P27870 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms