Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkchP23298 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms