Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PparaP23204 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PparaP23204 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PparaP23204 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms