Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pou3f1P21952 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms