Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms