Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkcaP20444 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms