Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18533 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18533 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18533 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms