Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18528 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18528 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms