Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms