Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spi1P17433 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spi1P17433 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms