Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou4f1P17208 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou4f1P17208 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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