Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Calm2P0DP27 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms